lncRNA测序_上海捷易生物科技有限公司

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关于捷易

上海捷易生物科技有限公司（Shanghai Gemple Biotech Co.Ltd）于2010年3月，由国内外知名学府的多名生命科学和临床医学从业者始立。公司落户在张江高科生物医药核心园区，专注于新一代技术在遗传病的临床检测以及科研转化两大领域的产业化应用。捷易长期致力于遗传病从分子诊断到疾病建模—遗传疾病转化研究整体服务解决方案。

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聚焦科研研究新热点--lncRNA

长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA) 指的是长度在200-100000 nt之间的RNA分子。它们不编码蛋白，但参与细胞内多种过程调控。近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默，基因组印记，染色质修饰，转录激活等多种重要的调控过程，lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点。

优越的服务平台优势

链方向特异性建库

低丰度转录本覆盖度高

常规建库样本量可低至100ng总RNA

高质量的文库制备，采用KAPA的核糖体去除rRNA建库试剂盒

扩增运用全球最强KAPA HiFi酶，有效降低扩增偏好性和增强覆盖度

50天	≥12Gb	ALL
项目周期	数据量	分析内容

强大的转录本测序服务团队

转录本生信分析.png

全面的生物信息分析

长链非编码RNA（lncRNA）测序能区分转录本来自正义链还是反义链，提供有关特定链的基因表达信息。该项测序技术帮助分析等位基因的特定表达，对于基因功能分析有十分重要的意义。

标准信息分析

. 原始数据预处理
. 基因组mapping，转录本组装
. 鉴定已知lncRNA
. lncRNA定量及差异分析
. 差异lncRNA靶基因预测
. 差异lncRNA靶基因的GO analysis
. 差异lncRNA靶基因的pathway analysis

高级信息分析

. 预测新的lncRNA
. lncRNA与靶基因网络构建
. lncRNA与mRNA共表达分析
. lncRNA序列与结构保守性分析
. lncRNA保守二级结构预测

全程服务项目每一个环节，助力科学研究

捷易致力于精准医学的科研服务。结合丰富的项目经验，专业的项目方案指导和分析流程，保证项目准确并且快速地进行。

技术团队	项目经验	结题项目	项目服务
20人+	2 年+	300+	1对1

常见问题

lncRNA 测序对物种有什么要求？

lncRNA 测序要求所研究物种必须具有参考基因组。
lncRNA 测序获得的差异 lncRNA 如何进行筛选？

首先可以根据 fold change 值和 p value 对差异 lncRNA 进行筛选，然后通过 lncRNA 和mRNA 共表达分析，从关键基因或关键信号通路层面入手去锁定目标 lncRNA，另外可以通过 lncRNA 高级分析从 lncRNA 的 cis 和 trans 调控机制层面入手，锁定目标 lncRNA。
lncRNA 测序和 lncRNA 芯片这两种技术如何选择？

对于选择 lncRNA 芯片还是 lncRNA 测序进行研究，主要基于您的研究目的和现有的数据库。由于现阶段， lncRNA 的研究主要集中在人、大小鼠上，并且其公共数据库信息较完善，因此针对人、大小鼠的研究， lncRNA 芯片基本上就能够满足绝大部分研究需求。而对于其他物种的 lncRNA 研究，目前还没有商品化芯片产品可以使用，因此可以考虑采用lncRNA 测序的技术。
lncRNA 测序通过数据分析得到的结果如何验证？

因为转录组分析中序列组装的复杂性，可以通过传统克隆或者 PCR 的方法验证分析结果，差异表达的 lncRNA 也可以用定量 PCR 的方式进行验证。