全转录组测序_上海捷易生物科技有限公司

全方位解决转录组分析需求

全转录组（whole transcriptome）是指特定物种、组织或细胞类型在某个时期或条件处理下，转录出来的所有RNA（转录本）的总和，包括mRNA和非编码RNA（ncRNA）。目前所说的全转录组测序，主要检测mRNA和三种ncRNA，即lncRNA、circRNA和miRNA。

二代测序技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息，从而准确地分析不同转录本的表达差异、基因结构变异、发现未知转录本和稀有转录本、筛选分子标记（SNPs或SSR）等生命科学的重要问题。

应用领域广泛

临床样本检测

应用于疾病研究和个体化医疗

多组学研究

深入挖掘转录水平的调控作用及生物学意义

肿瘤研究

使用RNA-seq技术可以预测潜在的融合基因

优越的服务平台优势

低丰度转录本覆盖度高

常规建库样本量可低至100ng总RNA

高质量的文库制备，构建去rRNA文库和miRNA文库

扩增运用全球最强KAPA HiFi酶，有效降低扩增偏差和增强覆盖度

60天	≥15Gb	ALL
项目周期	数据量	分析内容

全面的生物信息分析

全转录组测序可观察疾病发生过程中病灶部位内部的基因表达水平变化；在肿瘤研究中，使用RNA-seq技术可以预测潜在的融合基因；转录本信息的联合分析，为发病机制或药物筛选提供指导；新物种的转录组数据构建和功能研究。

基础信息分析

. 原始数据处理和质控
. 基因组比对
. 基因表达丰度分析
. 基因差异表达分析
. 差异表达基因的功能和通路富集分析
. 差异表达基因的聚类分析

高级信息分析

. 可变剪接分析
. 新转录本预测及分析
. 融合基因分析
. SNP/InDel检测与注释分析
. 与miRNA或lncRNA数据的联合分析
. 非编码RNA分析
. ceRNA分析
. 基因间、蛋白间相互作用网络分析
. 整体样本的主成分(PCA)分析

技术团队	项目经验	结题项目	项目服务
20人+	2 年+	300+	1对1

技术团队

项目经验

结题项目

项目服务

20人+

2 年+

300+

1对1

常见问题

什么是转录组测序？

转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括 mRNA和非编码RNA 。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点，通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。
外显子捕获测序和转录组测序分析有什么不同？

外显子捕获测序和转录组测序都是针对基因组上转录区域进行测序，但是外显子捕获测序针对已有基因组信息的物种，而转录组分析既能针对已有基因组信息的物种，也能针对没有基因组信息的新物种，因此，两者的分析存在一定的差异：（1）分析的目标区域有所不同。外显子捕获测序只针对基因组上已知的编码区，而转录组测序不仅针对基因组上已知的编码区，还能够检测非编码RNA等转录组的信息。（2）分析的手段所有不同。外显子捕获测序只需要把测序结果比对基因组，分析序列差异。转录组测序既可以把测序结果比对基因组，也可以进行从头（de Novo）拼接。（3）得到的结果有所不同。外显子捕获测序可以得到序列变异的信息，而转录组测序不仅可以获得已知序列的变异信息和新的转录本信息（针对从头拼接），还可以得到表达谱信息。除此以外，转录组测序还能够分析mRNA的可变剪接，而外显子捕获测序的样品来源是基因组，不能够进行mRNA的可变剪接分析，只能够得到外显子上的序列变化。